上海市皮肤病性病医院主要设置以下科室：“皮肤一科”“皮肤二科”“性病科”“特诊部”“综合治疗科”“老年科”“麻风科”“激光美容中心”“化妆品研究室”
其中
“皮肤一科”
以西医治疗为主，充分运用我院自制制剂优势，对多发性、常见性、疑难性
皮肤病进行治疗，具有疗效好、安全性高、价格适中的特点。每周设有
银屑病、甲真菌病、病理专题门诊和
专家门诊，形成鲜明的专科治疗特色，在社会上享有较高知名度和特色性治疗品牌效应。
“皮肤二科”
以中西医结合为方向，在我院长期中医治疗皮肤病的基础上，不断吸收和采用中西医领域的新进展、新技术，针对慢性、顽固性、疑难性皮肤病，运用中医辨证施治的原则，形成“个体化”特色性中西医结合诊疗方法。
“
性病科”
是上海市第一家开设的性病门诊；第一家实行病人就诊时不记真实姓名和地址；第一家发起本市性病
艾滋病三级防治网；曾作为卫生部—欧盟全国师资培训基地，为本市及全国培训了上千名临床医生和师资。我院长期承担性病治疗、预防与监控工作，解放初期为上海市消灭性病做出过重大贡献。现性病门诊是全国规范化门诊，还担负着全市性病诊疗质量监控工作，在性病治疗与研究方面有突出成绩和较大的影响力。
“特诊部”
1、上乘的服务:有专人为您挂号、取药、取检验报告、注射等“一门式”服务，让您足不出户享受一流的服务。 2、一流的医疗:就诊医生均为副高以上职称的专家，具有丰富的临床经验，为您提供热情、认真、负责的服务。 3、舒适的环境:有安静、优雅的就诊环境，有良好的私密性，保证了您和医生的最大程度的沟通。 4、健康美容咨询:我院率先提出“健康美容”新主张。有专业的皮肤科医生、科学的检测仪器，准确地告诉您的皮肤状况，指导您正确使用美容护理产品，还您健康美丽的皮肤。
“综合治疗科”
包括手术室、光动力室、激光室、光疗室等多个二级治疗科室，除皮肤科传统药物治疗手段外，拥有多种先进的治疗设备和现代治疗手段的新领域。通过手术、激光及各种光疗对多种皮肤良性和恶性
肿瘤，银屑病、
湿疹、
白癜风、
玫瑰糠疹、痒疹、掌跖脓庖病、
带状疱疹及其后遗神经痛、
尖锐湿疣等诸多顽固性皮肤病，具有较好的治疗效果。其中ALA光动力治疗在皮肤科应用与研究方面居全国领先地位。
“老年科”
拥有100张床位，病房按A、B、C三级要求进行规范配置，科室在提高医疗质量的同时，不断创新医疗服务理念，倡导人文关怀，努力为病人提供全过程、全方位的优质服务，是一个集治疗、护理与康复服务于一体的特色科室。我院也是目前本市唯一的一所三级老年护理
医院。
“
麻风科”
是上海唯一的专治麻风病的医疗机构，曾为上海基本消灭麻风病做出了巨大的贡献，现有已治愈的麻风病人140床位在院内安度晚年。在院内设立独立的诊疗病区。
“激光美容中心”
本中心有专业皮肤激光美容医师执诊。中心宗旨是：还您自信，还您健康、给您美容、给您的生活和工作带来新的希望及更美好的未来。
“化妆品研究室”
化妆品皮肤科学和化妆品研究领域中，根据中国人体皮肤特性，在国内率先开展生物学工程技术和细胞及分子生物技术在皮肤病理和毒理学中的应用，填补了国内在该技术领域的空白，是卫生部指定的化妆品安全评价实验单位。
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